После смертельной размолвки из-за женщины два самых опасных наёмника в городе, Нико и Рик, разошлись в разные стороны. Их некогда бесстрашный дуэт стал печальным воспоминанием, пока новость о появлении могущественного криминального авторитета и его подручных — жестоких и невероятно стильных братьев Сергеевых — не заставила их бывшего работодателя вновь их собрать.
После событий первого фильма синий еж Соник продолжает жить в Грин-Хиллз, мечтая стать настоящим героем. Его шанс представился, когда доктор Иво Роботник, сбежавший с прошлой битвы, вернулся с новым, грозным союзником — хитрым и сильным ехидной Наклзом. Их цель — легендарный Изумрудд Силы, артефакт невероятной мощи, способный стирать целые цивилизации с лица земли.