Год спустя после событий первой части Чебурашка продолжает жить в мастерской Гены Крокодила. Их дружба проходит новую проверку: Ушастик, растущий и набирающийся смекалки, всё чаще проявляет самостоятельность, порой граничащую с хулиганством, что вызывает непонимание со стороны Гены, пытающегося наставить его на путь разума.
17-летний первокурсник Женя, оказавшийся в научно-исследовательском центре на экскурсии, попадает в самый неожиданный контекст своего обучения. Случайный контакт с испытательным образцом робота «Апостол» (A.P.O100L), наделённым собственным сознанием и волей, переворачивает его жизнь. Робот, получив нежеланного оператора, принимает радикальное решение — сбежать из лаборатории, чтобы исследовать...