Продолжение истории о борьбе с древними морскими чудовищами. Пять лет после событий первого фильма Джонас Тейлор, уже известный как борец с экологическими преступлениями, возвращается в бездну. Вместе с командой исследователей он опускается на дно Марианской впадины — в скрытую миллионы лет экосистему, где обитают невиданные существа, включая гигантских мегалодонов.
Международная научная программа по изучению подводной жизни терпит крушение, когда глубоководный батискаф с экипажем на борту становится мишенью для существа, которое наука считала давно вымершим — гигантского мегалодона. Аппарат оказывается на дне Марианской впадины, и время команды на исходе. Китайский океанограф-новатор, несмотря на опасения своей дочери Суинь, вынужден обратиться за...