Фильм «Темные воды» основан на поразительной реальной истории, которая разворачивается в конце 1990-х. Молодой фермер из Западной Вирджинии, Wilbur Tennant, обращается к адвокату Роберту Билотту с необычной просьбой: investigateть странные смерти и болезни у него на ферме и в окрестностях. Его подозрения падают на близлежащий завод корпорации DuPont, гиганта, на котором работают почти все...
В мире высоких технологий и строгих расчётов инженер Хелен сталкивается с чем-то, что не поддаётся логике. После трагической гибели её мужа Уэллса во время работы над секретным проектом по изучению путешествий во времени, в её жизнь врывается его коллега Томас. Он раскрывает шокирующую деталь: незадолго до смерти Уэллс и он совершили прорыв, взломав код, открывающий доступ к временным линиям.
Нью-Йорк, середина 1960-х. Уолтер и Клара Стекхаус кажутся миру образцовой супружеской парой: он — талантливый архитектор, она — элегантная хозяйка и успешный риелтор. За фасадом благополучия тлеет медленный кризис: удушливая ревность, истерики и постоянные угрозы Клары покончить с собой изматывают Уолтера, заставляя его думать только о разводе.