Действие разворачивается в 1925 году. Кристофер Дюбуа, главарь шайки беспризорников, вынужден бежать из Нью-Йорка, спасаясь от полиции и преступных авторитетов. Его путь лежит через жестокие морские приключения: плен у контрабандистов, встреча с пиратами под командованием циничного Эдгара Доббса, который в итоге продает его в рабство подпольному промоутеру боев.
Культовый Тромавилль снова становится ареной хаоса в третьей части сатирической франшизы «Атомная школа». После событий предыдущих фильмов город сталкивается с новой, ещё более абсурдной угрозой — вторжением армии сабгуманоидов, гибридов людей и рептилий, созданных в секретной лаборатории. Во главе этого вторжения стоит безумный учёный доктор Слэг, поддерживаемый коварной профессоршей Холт.
Вторая часть культовой серии "Атомная школа" переносит действие в Тромовилльский технологический институт, где очередная авария на ядерном объекте вызывает новую волну абсурдных мутаций. Фильм продолжает традиции первой части, сочетая гротескный трэш с сатирическим взглядом на образование, науку и подростковую культуру конца 80-х — начала 90-х.