Вторая часть перезапуска серии о юном супергерое углубляется в личные драмы Питера Паркера. Он по-прежнему защищает Нью-Йорк, но его отношения с Гвен Стейси набирают сложность из-за обещания, данного её отцу. Параллельно в городе появляются новые опасные злодеи: Макс Диллон, превращённый в электрогенератора Электро, и Гарри Озборн, становящийся Зелёным гоблином.
Агентство ЦРУ сталкивается с катастрофой: во время рискованной миссии погибает один из лучших оперативников, выпускник Гарварда, работавший над секретным проектом. Чтобы не терять многомесячные усилия, руководство принимает отчаянное решение — заменить погибшего его братом-близнецом. Однако сходство внешнее, а характер и навыки — противоположны.