Фильм «Корни» переносит зрителя в судьбу Касыма, мальчика, оставшегося без родителей в суровые предвоенные годы. Его путь начинается в казахстанском интернате, где в условиях трудных лишений он не только находит настоящих друзей, но и раскрывает в себе талант стрелка. Эти навыки, обретаённые в юности, позже станут crucial в годы Великой Отечественной войны, куда он уйдёт уже юношей.
2009 год. Небольшой город на берегу легендарного озера Иссык-Куль в Кыргызстане. Здесь сталкиваются два мира: мечта seventeen-летнего Актана, решившего посвятить жизнь службе в Комитете национальной безопасности, и жестокий закон сильных, которым руководствуется местный депутат, готовый на всё ради спасения своего сына Алана от ответственности.