В 2005 году режиссёр Дзюнъя Сато обращается к одной из самых трагических страниц Второй мировой войны — последнему походу линкора «Ямато». Фильм «Ямато» (яп. Otoko-tachi no Yamato) строится вокруг двух временных пластов: современности, где молодая женщина Макико Утида пытается найти в океане место, где 60 лет назад погиб её отец, и воспоминаний ветерана, служившего на легендарном корабле.
В глубине японских гор существует тайная школа, где с детства отбирают одарённых детей и превращают их в бесстрашных воинов-убийц. Жёсткая дисциплина, изнурительные тренировки и безжалостный отбор оставляют в живых лишь самых сильных. Когда десять выпускников выходят в последний бой, выживает лишь одна девушка — Адзуми, получившая миссию предотвратить надвигающуюся гражданскую войну путём...