Действие разворачивается в 1630 году, когда семья пуританских поселенцев, во главе с отцом Уильямом и матерью Кэтрин, покидает общину и обосновывается на уединённой ферме у окраины густого леса в Новой Англии. Их попытка жить по строгим религиозным принципам вдали от цивилизации сталкивается с суровой природой и нарастающим чувством одиночества.
Нью-Йорк, шумный и яркий карнавал Хэллоуина. В толпе празднующих профессор Майк Кол теряет из виду своего маленького сына. Ни полиция, ни его собственные отчаянные поиски не дают результата — мальчик исчезает бесследно, словно растворившись в городской суете. Спустя год, не смирившись с потерей, Майк начинает собственное расследование и натыкается на ужасающую правду: город скрывает...
Фильм «Сайлент Хилл 2» продолжает мрачную историю Хизер, молодой женщины, чья жизнь с детства наполнена пугающими видениями. После очередного переезда с отцом, накануне восемнадцатилетия, она возвращается домой и находит его исчезновение, а на стене — таинственный знак, призывающий отправиться в город Сайлент Хилл.
Отчаявшаяся мать Роус, не сумев найти медицинской помощи для своей дочери Шэрон, страдающей от загадочной болезни, решает последовать за детскими сновидениями. Девочка incessantly повторяет название «Сайлент Хилл», и Роус убеждена, что именно там скрыт ключ к исцелению. Она везёт Шэрон в давно покинутый город, затерянный в тумане и окружённый мраком.