Продолжение культовой франшизы «Дети шпионов» переносит зрителей в современный мир, где опасность прячется за экраном смартфона и в виртуальной реальности. Семья Кортес, легендарные секретные агенты, теперь живут спокойной жизнью, но их покой рушится, когда Рональд — отец семьи и гениальный разработчик игр — выпускает вирус, который может взять под контроль весь мир.
Действие разворачивается в мрачном будущем, через три столетия после разрушительной войны, где человечество разделилось на элиту, живущую в небесном городе Скай-Ай, и простой народ, борющийся за выживание в руинах Железного города. Среди обломков цивилизации талантливый доктор-механик Идо Дайсон находит уникальные останки киборга и, восстановив её, даёт имя Алита.