Вторая часть франшизы о Джейсоне Борне продолжает историю амнезиата, сумевшего на время обрести покой. Теперь ему и его возлюбленной Мари приходится бежать по всему миру, становясь мишенью для целой системы, которая считает их угрозой. ЦРУ, стремящееся скрыть свои тёмные операции, пускает в ход все ресурсы: от профессиональных убийц до тотальной слежки.
Фильм начинается с археологической находки в пустыне Египта в 1928 году — таинственного металлического кольца, скрытого в песках веками. Многие годы спустя его дочь, учёный-лингвист, вместе с бывшим военным специалистом Джексоном расшифровывает его секрет на секретной военной базе. Оказывается, это «Звёздные врата» — технология древних, открывающая путь к другим мирам.