После событий первой части, Лу оказывается в серьёзной опасности, и его друзья Ник с Джейкобом решают воспользоваться всё той же загадочной машиной времени, спрятанной в джакузи. Их цель — вернуться в прошлое и предотвратить беду. Однако планы идут наперекосяк, и вместо привычной эпохи они неожиданно оказываются в далёком будущем, где встречают повзрослевшего Адама-младшего.
Фильм переносит зрителя в загадочный мир, отрезанный от внешней реальности. Главный герой Томас, лишённый воспоминаний, оказывается в сообществе подростков, запертых в огромном лабиринте. Их единственный дом — «Приют», а вся жизнь построена вокруг отчаянных попыток разгадать бесконечные коридоры, которые каждую ночь меняют свою структуру.