Действие фильма «28 лет спустя» разворачивается в мрачной, заброшенной Великобритании спустя почти три десятилетия после того, как страшный вирус «ярости» почти полностью истребил население и превратил выживших в диких, агрессивных существ. Оставшиеся клочки человечества живут в изоляции, а природа медленно возвращает свои права на руины городов.
Паддингтон, уже ставший полноправным членом семьи Браунов и гражданином Великобритании, получает тревожные вести из далёкой Перу. Его любимая тётушка Люси, которая когда-то привезла его из джунглей в Лондон, теперь нуждается в помощи. Не раздумывая, наш герой вместе с семьёй Браунов отправляется в{long-distance путешествие, чтобы найти её и разобраться в загадках, ждущих в сердце Южной Америки.