Фильм «Капитан Волконогов бежал» переносит зрителя в атмосферу ленинградского 1938 года, где паранойя и доносы стали нормой. Главный герой, бывший сотрудник органов капитан Фёдор Волконогов, оказывается в положении изгоя, вынужденный скрываться от тех, с кем ещё недавно работал рука об руку. Его побег — не просто попытка спасти жизнь, но и мучительный поиск искупления.
В центре истории — девушка, чьё лето проходит в атмосфере загородного курорта под пристальным взглядом матери. Её мир, кажется, ограничен заботливым, но тяжёлым контролем, пока в него не врывается парень с прошлым, окутанным слухами и тайной. Их встреча зажигает искру, которая быстро разгорается в сильное, всепоглощающее чувство.