История Чёрного Ангела начинается с трагедии, произошедшей на глазах у шестилетней Икко, дочери босса якудза: наёмные убийцы зверски расправляются с её родителями. Девочка тоже должна была стать следующей жертвой, но её спасает загадочная киллерша, известная под прозвищем Чёрный Ангел — именно она помогает Икко скрыться от преследователей.
