После провала спецоперации в Бангкоке карьера Лукаса Рейса, бывшего элитного агента, закончилась так же, как и его трезвость — дном бутылки. Его уединённое существование рушится, когда на пороге появляется Кэтрин Брант, его бывшая начальница, с отчаянным предложением: сесть на ближайший рейс до Сан-Франциско и вычислить среди пассажиров хакера по кличке Призрак.
Действие разворачивается в мрачном будущем, где остатки человечества живут под властью могущественных корпораций. После того как древняя инопланетная Машина, обнаруженная в недрах Земли, была случайно активирована, её технология начала превращать людей в безжалостных мутантов. Большинство колоний уже пало, а выжившие бегут в космос.