1863 год. Япония стоит на пороге масштабных перемен, и старый мир рушится в кровавой борьбе. В этом хаосе судьбы пересекаются у молодого сирота по имени Нио, чья преданность понятию о справедливости кажется анахронизмом в эпоху самурайских мечей и политических интриг. Его путь пересекается с двумя фигурами, чьи имена войдут в историю — Тосидзо Хидзикату и Окита Содзи.
Третья часть аниме-адаптации манги «Созданный в Бездне» продолжает опасное путешествие исследователей в самое сердце таинственного карстового колодца. После событий на четвёртом уровне команда Рико, неутомимого робота Рега и бывшей «пожирательницы душ» Нанати достигает Идофронта — последнего населённого людьми пункта перед абсолютной бездной.
Бегство из дома и полная потеря средств — так начинается новый этап в жизни шестнадцатилетнего Ходаки Морисимы. Оказавшись в огромном, но безразличном Токио, он вынужден ютиться в уединённом уголке города, где небо не видно сквозь вечные тучи и проливные дожди. Судьба сводит его с Хиной Амано, загадочной девушкой, чья тихая сила способна на мгновение очищать небо и дарить людям солнечный свет.