Продолжение приключений любимой компании древних животных. Саблезубый тигр Диего, мамонт Манфред, ленивец Сид и бесшабашный грызун Скрэт вновь собираются вместе, но угроза оказывается иной — не охотница или ледниковая эра, а куда более неожиданная проблема: стремительное таяние льдов. Идиллическая жизнь в тепле и воде оборачивается катастрофой, когда гигантский паводок начинает заливать их...
Независимая и свободная от религиозных догм Фрэнки Пейдж живёт в Питтсбурге, далёкая от вопросов веры. Её мир рушится, когда на теле внезапно проявляются стигматы — точные копии ран Иисуса Христа, кровоточащие без видимых причин. Этот мистический феномен мгновенно привлекает внимание Ватиканского расследователя отца Кернана, который видит в происходящем возможное божественное послание.