Фильм продолжает историю группы подростков, сумевших разрушить загадочный лабиринт, но обретённая свобода оказывается иллюзией. Выжившие, возглавляемые Томасом, Минхо и Терезой, попадают в руки секретной организации под названием ПОРОКА, которая ставит их перед новыми, ещё более жестокими испытаниями.
Фильм переносит зрителя в загадочный мир, отрезанный от внешней реальности. Главный герой Томас, лишённый воспоминаний, оказывается в сообществе подростков, запертых в огромном лабиринте. Их единственный дом — «Приют», а вся жизнь построена вокруг отчаянных попыток разгадать бесконечные коридоры, которые каждую ночь меняют свою структуру.